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科学研究

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生物信息学研究报告

作者:科研处 | 发布日期:2009-05-12 17:16:17
主讲人:张屹
时  间: 2009年5月14日下午2:30
地  点:新校区公共教学楼B208
附:主讲人简介
张屹,1972年10月出生。1994年毕业于内蒙民族大学, 2007年10月毕业于大连理工大学,获得理学博士学位。从事组合学和生物信息学的研究。正式发表SCI论文5篇,接受SCI论文1篇,其中三篇为JMC,三篇为CPLETT。主研项目有偏序集上的组合学与计数-枚举组合学的研、生物学中几个问题的数学模型及其优化(大连理工交叉学科建设专项)。 目前主持河北省教育厅项目一项:密码子偏好在药物靶点预测和进化树构建中的应用。 现正参加省部共建国家重点实验室—药物研究实验室的建设,并作为学术骨干筹建“生物信息学”实验室,主要从事大分子结构预测、病原体药物靶点预测和分子模拟的研究。
研究兴趣:
2004-2005年,主要从事氨基酸进化和DNA序列相似性的比较,改进了传统的对称码、循环码理论,提出了最优密码子配对方式和有效的序列图形比较方法。
 2006-2007年,主要从事密码子偏好的度量和应用研究,解决了丹麦科学家Fulsang在BBRC上提出的关于“密码子效率数”的问题,并反驳了他在Gene上发表的关于“某些氨基酸的最优密码子比其他氨基酸的最优密码子更优”的论断。 改进了哈佛大学教授Plotkin发表于Nature 428 (2004)942-945 上的挥发度的定义,现在正在此基础上,把改进后的定义导入到Plotkin的原算法中去,以期得到更好的靶点预测方法。
2008年,从事RNA二级结构的研究,蛋白质结构预测,线粒体基因组进化关系研究。提出了新的RNA预测算法和图表示法。提出LZ复杂度的标准化方法,给出新的物种进化树构建方法。分子动力模拟和药物设计。
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